南京一级建造师的部门是南京市住房和城乡建设局。

南京管理一级建造师的部门是南京市住房和城乡建设局，其联系电话为83689596。

在南京，一级建造师注册部门需要注意的事项包括：

1. 提交材料：申请一级建造师初始、重新注册、增项、注销等注册业务，应当提交近期一寸彩照1张及贴好相片申请表1张。

2. 审核材料：申请材料应齐全、合法和有效。

3. 提交申请：申请人员应当如实填报“一级建造师首次注册申请表”的相关信息并确认签名，提交本人身份证、学历证书、执业资格证书原件和复印件及所在企业聘用证明的原件和复印件。

4. 部门受理：对于申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当当场或者在五日内一次告知申请人需要补正的全部内容。

此外，南京人事考试和职称评审中心负责一级建造师的注册初审工作，并将初审意见提交南京市建委。南京市建委对初审意见进行审核，并在其官方网站上公示注册名单，公示期为十天。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能会因为实际情况而有所变化，建议咨询相关部门获取具体信息。