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1.肽单元(peptideunit)参与肽键的6个原子——Cα1,C,O,N,H,Cα2位于同一平面,Cα1和Cα2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成肽单元。
2.模序(motif)在许多蛋白质分子中,两个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个具有特殊功能的空间结构。一个模序总有其特征性的氨基酸序列,并发挥特殊的功能,如锌指结构,α-螺旋-环-α-螺旋。
3.结构域(domain)分子量大的蛋白质三级结构常可分割成1个和数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,具有独立的生物学功能,称为结构域。如纤连蛋白含有6个结构域。
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